Vanuit Nederland of België vlieg je in pakweg 3,5 uur naar Samos International Airport, dat ook wel Aristarchos Airport genoemd wordt. Het vliegveld ligt op vijf kilometer van de populaire badplaats Pythagorion, in het zuidoosten van het eiland Samos. Het vliegveld heeft één landingsbaan die een totale lengte kent van 2030 meter. Het vliegveld heeft geen taxibaan. Door middel van afslagen is de landingsbaan verbonden met de plaatsen voor de terminal.
Twee maatschappijen vliegen rechtstreeks vanaf Nederland naar Samos: Transavia en TUI. Bij Transavia kun je lijndiensttickets kopen waarbij je op het moment van boeken je vluchttijden al weet. Als je een pakketreis boekt met Transavia-vlucht, dan kan de betreffende vlucht ook een chartervlucht zijn waarvan de tijden soms pas één tot twee weken voor vertrek bekend gemaakt worden. TUI biedt met hun eigen maatschappij TUIfly vluchten aan van Amsterdam naar Samos. Omdat TUI nogal eens de neiging heeft tijden en routes aan te passen, kan het zo zijn dat de tijden vlak voor vertrek nog aangepast worden. Zeker in het voor- en naseizoen wil het gebeuren dat er op de heen- en/of terugvlucht een tussenlanding ingelast wordt, omdat ze twee bestemmingen met elkaar combineren. Andersom is echter ook mogelijk: dat er zoveel vraag is naar Samos dat ze een vlucht alleen naar Samos laten vliegen in plaats van te combineren met een andere bestemming.
Vliegtickets naar Samos beginnen vaak al bij iets meer dan honderd euro voor een retour, exclusief ruimbagage. Je moet er dan vaak wel vroeg bij zijn met het boeken. In het hoogseizoen kan de prijs voor een retourticket oplopen tot 400-500 euro per persoon.